たとえばしたのようにすると差分のあったファイルのみバックアップされます。
（なのでこのバックアップした時点のsorceフォルダを復元したいならdstにdst2を上書く）
rsync -av --delete-excluded --compare-dest=/root/dst/ /root/sorce/ /root/dst2/
↓のようにすると差分の無いファイルは転送を行わずに元ディレクトリdstからコピーします
ローカルコピーだとあまり意味はありません
rsync -av --delete-excluded --copy-dest=/root/dst/ /root/sorce/ /root/dst2/
↓のようにすると差分の無いファイルは前回のもののハードリンクになります
ディスク容量を節約できて便利です
rsync -av --delete-excluded --link-dest=/root/dst/ /root/sorce/ /root/dst2/
参考リンク
http://www.itmedia.co.jp/enterprise/articles/0804/25/news034.html